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質(zhì)粒抽提常見問題和解決

點擊次數(shù):2765 更新時間:2011-04-11
 

1.沒有提出質(zhì)?;蛘哔|(zhì)粒收獲量很低
  
  A菌種老化
  
  建議:對于甘油保存的菌種,需要先進行活化,涂布或者劃線菌種,重新挑選單菌落進行液體培養(yǎng),并對菌種進行初搖活化,按照1:500的比例進行菌種培養(yǎng)。二次培養(yǎng)時間不要超出16小時(或者OD600不超過3.0)。
  
  B低拷貝質(zhì)粒
  
  建議:如果是由于低拷貝質(zhì)粒引起的質(zhì)粒收獲量低,可以采用兩倍的菌體量,并相應增加各種Buffer的用量。
  
  C質(zhì)粒丟失
  
  建議:某些質(zhì)粒在次繼代培養(yǎng)的過程中會出現(xiàn)丟失的想象,另外檢查篩選抗生素的濃度是否正確。
  
  D裂解不充分
  
  建議:如果采用超過推薦量的菌體進行質(zhì)粒制備,會導致菌體裂解不充分??蛇m當減少菌體的用量或者相應增大各種Buffer的用量。并確保細菌混懸均勻。
  
  EBuffer中有沉淀未溶解
  
  建議:BufferB1和BufferN1,BufferC1在溫度較低時會出現(xiàn)沉淀,使用前請檢查是否有沉淀生成,如果有沉淀生成,請置于37℃溫育片刻,待溶液澄清后使用。
  
  FDNAWashBuffer中未加入要求量的乙醇
  
  建議:按照說明書要求加入要求量的無水乙醇,使用后旋緊瓶蓋,防止乙醇揮發(fā)。另外對于質(zhì)粒中提,大提等,要求用70%乙醇洗滌,請確保乙醇的體積不小于70%。
  
  G離心柱中乙醇殘留
  
  建議:漂洗后,可適當延長離心時間,盡量去除殘留的乙醇。另外對于質(zhì)粒中提,大提和朝大量提取,建議離心后,將柱子或大漏斗用吹風機冷風吹片刻(或置于65℃烘箱),以*去除殘留的乙醇,便于洗脫和后續(xù)實驗操作。
  
  H洗脫液加入位置不正確
  
  建議:洗脫液應加在膜*,已取得的洗脫效果。
  
  I洗脫液pH值不正確
  
  建議:將DNA從柱子上洗脫下來的zui適pH值在7.0-8.5之間,如果洗脫液的pH超出此范圍將會顯著影響洗脫效果,請使用試劑盒配套的ElutionBuffer(pH8.5,10mMTris-HCl)進行洗脫,如果用ddH2O進行洗脫,請確保pH在7.0-8.5之間。
  
  J洗脫體積的選擇
  
  建議:洗脫體積將會影響zui終的收獲量,洗脫體積越大,收獲量越高,但是濃度將會降低。請使用試劑盒推薦的洗脫體積進行洗脫,以保證的收獲量和濃度。如果需要高濃度的質(zhì)粒,請減少洗脫體積。另外,如果想收獲高濃度高收獲量的質(zhì)粒,請根據(jù)試劑盒要求進行二次洗脫,再用推薦的方法進行沉淀,濃縮質(zhì)粒。
  
  K洗脫時間的選擇
  
  建議:加入洗脫Buffer后,室溫放置2-5分鐘,將有利于洗脫。
  
  2.質(zhì)粒純度不高
  
  A蛋白質(zhì)污染
  
  建議:選擇推薦量的菌體,離心后小心吸取上清,如果上清液中混有懸浮物,可再次離心,以*去除蛋白。另外如果用ddH2O作為稀釋溶液,測定OD比值,比值可能較低,造成蛋白污染的假象,可用pH8.0的TEBuffer來稀釋。
  
  BRNA污染
  
  建議:檢查配送的RNaseA是否*加入到BufferA1中,加入RNaseA后,BufferA1/RNaseA應該存放在4℃,如果存放時間過長,或者沒有正確存放,RNaseA活力下降,請重新加入RNaseA。
  
  C基因組DNA污染
  
  建議:加入BufferB1后,輕輕顛倒混勻,避免劇烈震蕩渦旋,加入BufferB1的處理時間不要超過5分鐘。
  
  D菌株為含內(nèi)源核酸酶的宿主菌株
  
  建議:請選用含內(nèi)源核酸酶的宿主菌株質(zhì)粒DNA提取試劑盒,或者轉化質(zhì)粒到不含內(nèi)源核酸酶宿主菌株中。
  
  3.加樣時DNA飄出加樣孔外
  
  原因:柱中殘留乙醇未除干凈。
  
  建議:洗脫質(zhì)粒DNA前確保無乙醇殘留在柱子上??稍匐x心或者抽真空。

 
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